Lufttrafik er grænseoverskridende, og Naviair deltager derfor aktivt i det omfattende internationale samarbejde på området. Dette sker gennem deltagelsen i arbejdet i en række internationale organisationer der alle er beskrevet via menuen til venstre. Som en integreret del af den europæiske lufttrafiktjeneste skal Naviair levere en trafikafvikling, der tilfredsstiller de rejsende og luftfartsselskabernes ønske om sikkerhed, kapacitet og effektivitet, og som tager det størst mulige hensyn til klima og det fysiske miljø. Deltagelse i internationalt arbejde vil enten være en direkte del af Naviairs opgavevaretagelse eller understøtte udviklingen i luftfarten, herunder bistand til eller opgaver via Transportministeriet.